"Ich frage mich was ich machen will..." Der Junge der nichts besonderes an sich entdecken kann. Eines Tages während seiner Sommerferien, die er in einem ländlichen Dorf verbringt, entdeckt er im angrenzenden Wald einen seltsamen Jungen der von Feen aus Licht begleitet wird. "Ich werde von niemandem gebraucht..." Das Mädchen welches sich selbst nicht akzeptieren kann. Eines Wintertages entdeckt sie an einer Straßenecke in der Stadt eine Fee des Lichts die verwundet zu sein scheint. Ein reines Herz ist es, was diese Welt, die begonnen hat auseinanderzufallen, retten wird. Zettai Shounen ist eine Geschichte um einen Jungen und ein Mädchen, die von Feen des Lichts geleitet werden um diese Welt zu retten. Aizawa Ayumu ist ein Mittelschüler, der nicht zur Schule geht. Er verbringt gerade den Sommer bei seinem Vater in einem ländlichen Dorf, zwei Stunden von Tokyo entfernt. Seine Eltern sind geschieden und dies ist das erste mal seit vier Jahren, dass er seinen Vater wieder sieht. Zunächst war Ayumu unwillig hinzufahren, doch seine Mutter bot ihm ein Mountain-Bike an, falls er es sich überlegte. Nachdem er einige Tage dort verbringt scheint es so, dass zuletzt alles etwas seltsam in dem Dorf war. Blumen blühen außerhalb der Saison, sonderbare Lichter erscheinen am Himmel und die Leute verhalten sich komisch. Eines Tages als er mit seinem Fahrrad unterwegs ist, begegnet Ayumu einem kleinen Jungen, Wakkun, der mit ihm spielen möchte. Ayumu stimmt zu, doch der Junge ist auf einmal verschwunden und stattdessen entschwebt ein kleines Raumschiff gen Himmel. Kisa Tanigawa ist eine Oberschülerin in Yokohama, die sich selbst vor der Welt verschlossen hat. Sie besucht weder die Schule, noch hat sie viel mit anderen Leuten zu schaffen. Eines Abends als sie auf dem Weg nach Hause ist, sieht sie einige Kugeln aus Licht die gegeneinander kämpfen. Sie beschließt ihnen zu folgen, um später eine dieser Kugeln, welche sichtlich verletzt ist, in einem Tunnel zu finden. Sie nimmt es mit nach Hause, wo sie ihm einen Namen gibt, Bun-Chan, für das Geräusch welches es erzeugt. Als sie von Bun-Chan am nächsten morgen geweckt wird, wirft sie einen Blick nach draußen und sieht ein riesiges Objekt, welches wie ein UFO ausschaut, über der Stadt schweben. Für einen Moment wird es deutlicher um dann wieder zu verschwinden.