In der zweiten Staffel von Maria-sama ga Miteru ist gerade der Frühling angebrochen und das neue Schuljahr steht kurz davor zu beginnen. Wieder steht das Schulleben der "Rosen" und ihrer "Petit Soeurs" im Vordergrund - mit all den kleinen Problemen, die es so mit sich bringt. Diesmal gibt es u.a. sogar einen handfesten Streit zwischen Sachiko und Yumi zu sehen, der ihre Freundschaft auf eine harte Probe stellt.